El ICMAN, ubicado en una parcela de 2.000 m2, en el Campus Universitario de Puerto Real (Cádiz) cuenta con una serie de instalaciones, equipamientos y servicios que le permita el cumplimiento de sus objetivos científicos. Posee una nave principal y una aneja para la experimentación animal, cuenta con instrumental científico de última generación para la realización de su labor investigadora, así como de una unidad operativa de campo (OPECAM) que da soporte a los investigadores del centro en campañas oceanográficas y muestreos de campo. Dispone, asimismo, de servicios TIC y de Biblioteca con el fin de apoyar las líneas de investigación que se desarrollan en el Instituto.